Обаятельный немецкий дог снова в деле. Скуби и его банда в честь дня рождения Фредди, отправляются в морской круиз по Бермудскому треугольнику. На борту корабля их ждёт бал-маскарад на морскую тематику. Вскоре весёлый праздник превращается в настоящий ужас — пираты-призраки берут на абордаж туристический лайнер. Размахивая острыми клинками они сеют панику и смятение в рядах отважных детективов корпорации «Тайна». Некоторое время герои убегают и прячутся от безобразных разбойников, отдавая дань традициям классического мультсериала Уильяма Ханны и Джозефа Барберы. Но на этот раз зрителей ждёт неожиданный поворот сюжета — пираты похищают родителей Фредда и стремительно исчезают в мистическом тумане. Теперь Скуби, Шегги, Фредду, Дафне и Велме придётся разгадать множество тайн и загадок Бермудского треугольника, чтобы вернуть пропавших родственников в целости и сохранности.