Вместе со своими клонами Элис пытается уничтожить Альберта Вескера, главу спецподразделения корпорации «Амбрелла», усилиями которой почти все человечество было обращено в зомби. Схватка с Вескером приводит к уничтожению офиса под Токио, но сам злодей успевает скрыться. Элис отправляется на его поиски, а по дороге находит своих старых друзей из прошлых серий «Обители зла». Вместе они пытаются попасть на борт корабля «Аркадия», который подает сигнал для выживших людей…