Сан-Франциско взбудоражен поступающими сообщениями о живущем под водой огромном чудовище, нападающем на каждое подошедшее близко к нему судно. Люди в страхе отказываются выходить в море, и чтобы разобраться с этой ситуацией, правительство посылает военный корабль для исследования и очищения моря от «чудищ». Корабль тонет из-за «чудовища», и только три его пассажира спасаются. Выживших подбирает капитан Немо, изобретатель и радикальный борец за мир. Именно его подводная лодка и является тем самым монстром из глубин, который топит корабли…