Прошло несколько лет с тех пор, как агенты Кей и Джей предотвратили межгалактическую катастрофу. Кей вернулся к комфорту гражданской жизни, а Джей продолжил работать на Людей в черном, тайную организацию по слежению и контролю пришельцев на Земле. Во время очередного задания Джей сталкивается с новым инопланетным заговором. Для помощи ему требуется Кей, который не помнит о своей деятельности в агентстве, но в то же время является единственным экспертом по спасению Галактики…